EkklesiaNet tiene una fuerte convicción en considerar la autonomía de la Iglesia Local.
Este cimiento de convicción influye en todo lo que EkklesiaNet hace y sirve como una
guía a toda política que EkklesiaNet establezca. EkklesiaNet constantemente busca el
balance responsable de amor y de cuidado  a todo creyente en Cristo con el
reconocimiento especial al lugar donde Dios los ha establecido en su propia iglesia local.
La creencia de EkklesiaNet puede verse en tres formas.  

·  EkklesiaNet es un compañerismo de iglesias, no es una organización de ministros.
 Esto significa que iglesias con una visión y doctrina similar voluntariamente se asocian
 a la red de iglesias para el propósito de compañerismo, exhortación, expander visión,
equipar, fortalecerse y una relación de cubrir. 

·  Esto también significa que los miembros del compañerismo deben darse cuenta de que
cuando son parte de la red, no solo se pide  recursos y fortaleza, pero se esta indicando
que desean ser fructíferos para otros también dentro de la red.

·  EkklesiaNet provee una estructura y un contexto donde estas significativas relaciones
pueden ser cultivadas, pero depende de cada miembro junto con el liderazgo de EkklesiaNet
el sentir la responsabilidad personal del uno al otro “el  cubrir al hermano”. La sumisión no
es forzada pero una respuesta a una justa relación espiritual.

Autonomía y Responsabilidad

Una de las doctrinas fundamentales de EkklesiaNet es la
convicción que cada iglesia local tiene su propia autonomía de
organización. Esto significa que cada iglesia local tiene su propio
 gobierno, su propio sustento y su propia propagación.

Como hay un gran deseo de ser catalizadores en traer pastores e iglesias juntos para
llevar el propósito de compañerismo, relación y fortaleza, hay un igual deseo de
complementar la integridad de la estructura y autoridad de la asamblea local.